Кабінет Міністрів затвердив порядок відбору проектів з розроблення високих наукоємних технологій та контролю за їх реалізацією. Про це йдеться у постанові уряду від 16.12.2004 № 1679 «Про заходи щодо організації виконання Загальнодержавної комплексної програми розвитку високих наукоємних технологій», якою також затверджено склад конкурсного комітету на чолі з міністром промислової політики Олександром Неустроєвим.

Проекти на конкурс можуть подавати підприємства, установи та організації всіх форм власності. Бюджетне фінансування проектів здійснюється за умови їх конкурсного відбору. Обсяг коштів держбюджету для фінансування одного проекту, не може становити менш як 500 тис. грн та перевищувати 30 % загальної вартості проекту.

Основними критеріями відбору визначено такі: наявність джерел можливих позабюджетних інвестицій та імовірність їх надходження; науково-технічний рівень технологій, порівняно з кращими світовими аналогами; ступінь урахування ризиків; рівень конкурентоспроможності; ступінь захисту прав інтелектуальної власності, які здійснюються або набуваються під час реалізації проекту; наявність обґрунтованих висновків щодо реальності обсягів її виробництва та збуту продукції; рівень забезпечення виконання вимог технічної та екологічної безпеки; соціальна та економічна ефективність; забезпечення зростання обсягів експорту, зменшення обсягів імпорту.