В отношении Ваших прав на название фирмы все зависит от ситуации и соотношения Ваших авторских прав (как автора, придумавшего название), прав на фирменное наименование и прав на товарный знак.
Если Вы придумали название для фирмы, например, фантазийное слово "Магистраль", и затем фирма была зарегистрирована в виде, например, ООО "Магистраль" или ЗАО "Магистраль". Если бы сразу была подана заявка на товарный знак на имя ООО "Магистраль", то владельцем этого товарного знака была сама фирма. Это был бы наиболее распространенный и законный способ использования товарного знака.
Поскольку, как я понял, название фирмы не регистрировалось в качестве товарного знака, то в настоящее время может возникнуть коллизия между этими тремя видами прав.
Если Вы зафиксировали авторские права на название фирмы (например, в ГСИСУ или у нотариуса) до регистрации фирмы, то можете также и претендовать на защиту его за Вами в качестве товарного знака. То есть, можете подать заявку на товарный знак и получить регистрацию, если фирма уже не опередила Вас с подачей аналогичной заявки, а также если ранее третьим лицом уже не зарегистрировано такое название.
При этом необходимо учитывать последующую коллизию между фирменным наименованием и товарным знаком, включающим полностью или частично фирменное наименование.
Поскольку Закон о товарных знаках препятствует регистрации товарного знака при наличии более ранней регистрации фирменного наименования, то нельзя исключить и возможность отказа Роспатентом по Вашей заявке на этом основании, если эксперт найдет сведения о Вашей бывшей фирме, например, в Интернете.
Однако даже если эксперт не найдет такой информации и товарный знак зарегистрируют на Вас, новый владелец фирмы будет вправе подать протест против Вашей регистрации, ссылаясь на указанный Закон. При этом результат спора трудно предсказать, т.к. с одной стороны, фирменное наименование зарегистрировано раньше, а с другой - авторское право было еще раньше. Вероятно, этот случай придется разрешать в суде.
Полагаю, что если авторские права на название не были за Вами зафиксированы, а также не было соответствующего договора в отношении Вас, как автора названия, и фирмой в части передачи прав фирме на это название (с указанием, что эти права изначально принадлежат Вам и после ухода из фирмы Вы вправе использовать это название, а фирма - нет), то преимущественное право на регистрацию товарного знака будет у фирмы. Если же вы опередите ее с регистрацией, то, как указано выше, фирма сможет опротестовать в Укрпатенте и в суде такую регистрацию.
Целесообразность регистрации знака на Вас может состоять в том, чтобы использовать ее в качестве аргумента при разрешении имущественных отношений с фирмой. То есть, если у Вас есть к фирме претензии, такая регистрация позволит Вам предъявить требование о запрете использования товарного знака, а фирма, во избежание длительного и дорогостоящего рассмотрения дела в Укрпатенте и судах, может пойти Вам навстречу. При этом в случае достижения соглашения Вы сможете в обмен на финансовые или другие выгоды переуступить товарный знак фирме. Уточню, что такая уступка требует обязательной регистрации в Укрпатенте.